Nature відкликав статтю 2014 року про зсув рамки зчитування в мРНК CCR5
Nature відкликав статтю 2014 року про зсув рамки зчитування в мРНК CCR5 через артефакт сплайсингу в експерименті.
Редактори журналу Nature відкликали статтю 2014 року про програмований зсув рамки зчитування рибосоми в матричній РНК гена CCR5. Рішення ухвалили через втрату довіри до даних, на яких ґрунтувався один із ключових висновків дослідження.
Артефакт сплайсингу
У первинній роботі послідовність CCR5, яку вважали здатною викликати зсув рамки зчитування на один нуклеотид, клонували у вектор із подвійним люциферазним репортером. Подальша перевірка показала, що ця послідовність містила прихований сайт акцептора сплайсингу на 3′-кінці. Через це утворювалися артефактні варіанти сплайсингу.
У редакційній примітці зазначено, що саме цей ефект міг створити враження про активність зсуву рамки зчитування в експерименті.
Результати повторних тестів
Під час спроби відтворити результати автори використали вдосконалену версію репортерної системи. У ній промотор SV40 замінили сильним промотором CMV, а штучний інтрон прибрали. За таких умов послідовність CCR5 не продемонструвала виявного рівня програмованого зсуву рамки зчитування на один нуклеотид.
За даними редакторів, ці результати повторили щонайменше дві інші дослідницькі групи. Четверо авторів — Ashton Trey Belew, Sharmishtha Musalgaonkar, Vivek M. Advani та Sergey O. Sulima — погодилися з відкликанням. Arturas Meskauskas, Wojciech K. Kasprzak, Bruce A. Shapiro та Jonathan D. Dinman із ним не погодилися.
