Науковці змоделювали ембріогенез мишей із хімічно індукованих стовбурових клітин

Дослідники описали модель ембріогенезу мишей, створену з хімічно індукованих тотипотентних стовбурових клітин — ciTotiSCs. Роботу опублікував Nature. Автори вивчали, чи можуть такі клітини формувати структури, подібні до бластоцист, і відтворювати ранні етапи розвитку ембріона миші.

Хімічна індукція клітин

У дослідженні використовували мишачі ембріональні стовбурові клітини з репортерами MERVL-tdTomato та OCT4-GFP. Їх культивували в середовищах 2i/L, TAW і TAWa. У додаткових даних наведено зображення клітин та теплові карти експресії генів, пов’язаних із тотипотентністю та плюрипотентністю.

Науковці також зіставили профілі ciTotiSCs із клітинами ембріонів мишей на середній і пізній двоклітинних стадіях. Аналіз охоплював програми материнських генів і гени, пов’язані з активацією зиготичного геному, а також оцінку показників плюрипотентності й тотипотентності окремих клітин.

Аналіз даних

Для дослідження автори застосували одноклітинне секвенування РНК. Отримані дані scRNA-seq передали до бази NCBI Gene Expression Omnibus під номером GSE292862. Код для аналізу та візуалізації цих даних автори розмістили у відкритому репозиторії GitHub.

Над проєктом працювали науковці з Університету Цінхуа, Пекінського університету, Dana-Farber Cancer Institute та інших установ. Автори заявили про відсутність конфлікту інтересів.