У тканинах мозку виявили понад 1000 недооцінених мікропротеїнів
Науковці виявили тисячі мікропротеїнів у тканинах мозку, частина з яких пов’язана зі змінами при хворобі Альцгеймера.
Дослідники створили найбільший на сьогодні атлас мікропротеїнів у тканинах людського мозку та виявили понад 1000 молекул, існування яких було підтверджено з високою впевненістю. У десятків таких малих білків експресія відрізнялася в людей із хворобою Альцгеймера, повідомляє Nature.
Атлас малих білків
Мікропротеїнами називають білки, що складаються менш ніж зі 150 амінокислот. Їх важко виявляти стандартними методами генетичного й білкового аналізу через малий розмір. Частина цих білків утворюється з ділянок геному, які раніше вважали нездатними кодувати білки, а частина — з генів, що також продукують більші, уже відомі білки.
У дослідженні, опублікованому 14 вересня в журналі Nature Aging, науковці проаналізували 608 посмертних зразків дорсолатеральної префронтальної кори. Ця ділянка мозку бере участь у когнітивному контролі. До вибірки увійшли зразки людей із хворобою Альцгеймера та без неї.
Поєднання методів
Команда застосувала мас-спектрометрію, секвенування РНК і рибосомне профілювання. Останній метод дає змогу досліджувати молекули матричної РНК, пов’язані з рибосомами — клітинними механізмами синтезу білків.
Загалом дослідники ідентифікували 4321 мікропротеїн. Із них 3217 раніше не були охарактеризовані у стандартному каталозі білків людини UniProtKB/Swiss-Prot. Далі для 3001 мікропротеїну використали модель глибокого навчання, яка оцінила надійність їхнього виявлення за даними мас-спектрометрії. Для 1067 мікропротеїнів модель визначила високий рівень упевненості.
Автори зазначають, що створений набір даних не встановлює біологічних функцій виявлених білків. Водночас вони зробили послідовності мікропротеїнів доступними для інших лабораторій, які зможуть перевіряти їх у подальших експериментах.
