Anthropic знайшла у вірусах ДНК-послідовності схожі на CRISPR

Компанія Anthropic оголосила про виявлення в геномах кількох гігантських вірусів повторюваних послідовностей ДНК, схожих на елементи мікробних систем CRISPR. Пошук провели автономні ШІ-агенти в межах нового напряму досліджень у галузі наук про життя та лабораторії компанії. Як повідомляє Nature, функція знайдених вірусних послідовностей наразі не встановлена.

Роботу оприлюднили 23 вересня на платформі alphaXiv разом із препринтом, який ще не пройшов рецензування. Дослідники Anthropic зазначають, що наразі не мають доказів того, що ці повтори виконують таку саму роль, як відповідні послідовності у CRISPR-системах бактерій.

Пошук у геномних базах

У першому експерименті залучили приблизно 950 ШІ-агентів. Вони понад 21 годину самостійно аналізували базу ДНК-послідовностей, що кодують мільярди білків: обговорювали попередні результати та визначали наступні кроки пошуку.

Спочатку агентам доручили знайти білки, які можуть взаємодіяти з ферментами зворотної транскриптази. Досліджуючи ділянку ДНК поруч із геном зворотної транскриптази одного з гігантських вірусів, вони помітили коротку послідовність букв ДНК, що багаторазово повторювалася. Надалі подібні патерни виявили в геномах інших вірусів.

Чим це відрізняється від CRISPR

У бактеріальних CRISPR-системах повторювані фрагменти ДНК розділені ділянками, скопійованими з вірусів або інших чужорідних агентів. Під час нового вторгнення РНК, утворена з цих ділянок, спрямовує пов’язаний фермент до ДНК чужорідного організму, де той розрізає геном.

Для виявлених у вірусів повторів такого механізму поки не показано: поруч із ними не відомий фермент, здатний розрізати ДНК. Керівник напряму наук про життя Anthropic Ерік Каудерер-Абрамс назвав знахідку перспективним напрямом, але зазначив, що для визначення її функції та можливого створення нового інструменту потрібна повна характеристика системи й експерименти у фізичній лабораторії.