CEPI розробляє ШІ-інструмент для підготовки до нових пандемій

Коаліція за інновації у сфері готовності до епідемій (CEPI) працює над інструментом Pandemic Preparedness Engine for Disease X, який має об’єднати фрагментовані наукові дані та допомагати дослідникам розробляти вакцини й інші медичні засоби проти нових патогенів. Про це в інтерв’ю Nature розповіла керівниця напряму інновацій даних у дослідженнях і розробках CEPI Поліна Брангель.

За її словами, система задумана як спільний науковий інструмент, здатний інтегрувати, зокрема, дані про геномні послідовності з різних джерел. Дослідник, який виявить новий варіант вірусу Ніпах, зможе ввести до системи його геномну послідовність і місце виявлення. ШІ-агент має запропонувати способи створення або коригування антигенів для формування потрібної імунної відповіді.

Підготовка до Disease X

Термін Disease X Всесвітня організація охорони здоров’я запровадила у 2018 році для позначення гіпотетичного патогену, який може інфікувати людей. ВООЗ сформувала перелік пріоритетних збудників, здатних спричинити пандемію та таких, для яких немає доступних вакцин, діагностичних засобів або методів лікування.

Методологічна програма CEPI зосереджена на 25 відомих родинах вірусів, що можуть інфікувати людину; більшість із них мають тваринне походження. Серед них — філовіруси, до яких належить вірус Ебола, коронавіруси, зокрема SARS-CoV-2, а також ортофлавівіруси, що спричиняють денге, жовту гарячку та Зіку. Оскільки створити вакцини проти всіх 25 родин неможливо, фахівці визначають патогени з найбільшою ймовірністю інфікування людей та накопичують відомості про їхні геномні послідовності.

ШІ та зіставність даних

Брангель зазначила, що патогени мають мутувати, аби перейти від тварин до людей. Для прогнозування таких змін застосовують комп’ютерне моделювання, а найбільш імовірні варіанти надалі використовують у ШІ-інструментах для розроблення й тестування вакцинних послідовностей та планування клінічних випробувань.

Досвід пандемії COVID-19, за словами дослідниці, продемонстрував проблему порівнюваності даних. Різні лабораторії застосовували точні, але неоднакові тести на антитіла, тому їхні результати було складно зіставити. Спільно з колишньою агенцією Public Health England запровадили міжнародний стандарт для оцінювання таких аналізів. Брангель наголосила, що надійної науки недостатньо без гармонізації даних, які використовують для ухвалення рішень.

Вона назвала трьома ключовими можливостями ШІ швидкість, інтеграцію даних із різних джерел і федеративний доступ, за якого можна навчатися на інформації, що залишається у власника — державного органу або комерційної компанії.