Дослідники описали зв’язок стресу лізосом з активацією TFEB
Дослідники описали вісь TBK1/ULK1, що пов’язує стрес лізосом з активацією транскрипційного фактора TFEB.
Міжнародна група дослідників описала сигнальну вісь TBK1/ULK1, яка пов’язує стрес лізосом з активацією транскрипційного фактора TFEB. Роботу опублікував журнал Nature.
У дослідженні аналізували механізми, що регулюють TFEB — фактор, пов’язаний з аутофагією та біогенезом лізосом. Автори зосередилися на ролі TBK1 і ULK1 у клітинній відповіді на порушення роботи лізосом.
Експерименти з варіантами ATP6V1B2
В одному з експериментів на клітинах HEK293T, що експресували TFEB-GFP, науковці досліджували варіанти білка ATP6V1B2 — Y371C та R400Q. За даними розширених матеріалів статті, ці патогенні варіанти спричиняли активацію TFEB без впливу на вісь RagA–mTORC1.
Клітини вирощували з індукованою експресією нормального або зміненого HA-ATP6V1B2, а потім піддавали голодуванню чи повторній стимуляції амінокислотами. Дослідники також застосували qRT-PCR для оцінки відносних рівнів мРНК визначених генів.
Дані та учасники роботи
До роботи долучилися науковці з Telethon Institute of Genetics and Medicine в Неаполі, Університету Фрібура, Каліфорнійського університету в Берклі, Університету Людвіга-Максиміліана в Мюнхені та інших установ. Внесок у дослідження включав фосфопротеомний аналіз, аналізи активності кіназ in vitro, редагування клітинних ліній CRISPR–Cas9 і дослідження даних пацієнтів.
Протеомні дані автори розмістили в репозиторії PRIDE консорціуму ProteomeXchange під ідентифікаторами PXD069600 і PXD063015. Кореспондентом роботи зазначено Дженнаро Наполітано.
