Hugging Face представила відкриту ШІ-модель для аналізу ДНК
Hugging Face представила Carbon-X — відкриту ШІ-модель, що аналізує фрагменти ДНК та відповідає на запитання природною мовою.
Платформа Hugging Face представила відкриту модель штучного інтелекту Carbon-X для аналізу ДНК, яка може працювати локально на ноутбуці. Модель створили спільно з дослідниками Академії Чжунгуаньцунь у Китаї та Неаполітанського університету імені Федеріко II в Італії, повідомляє Wired.
Carbon-X навчали на геномних послідовностях і текстах природною мовою. Користувачі можуть ставити запитання про те, як зміни в ДНК здатні впливати на активність генів і здоров’я, та отримувати відповіді у розмовному форматі.
Як працює модель
Команда взяла за основу наявну мовну модель і розширила її словник, щоб вона могла читати ДНК групами по шість літер. Потім її додатково навчали на 300 мільярдах токенів, що поєднували послідовності ДНК, англомовні тексти та приклади зв’язку генетичних даних із біологічними описами.
До навчальних даних увійшли послідовності ссавців, зокрема людей, інших хребетних, безхребетних, рослин, грибів і найпростіших. Вірусні дані до моделі не включали, щоб уникнути її використання для потенційно небезпечних застосувань.
Обмеження та можливе застосування
Carbon-X здатна обробляти фрагменти ДНК завдовжки приблизно 50 тисяч пар основ, тому користувачі не зможуть завантажувати до неї повний геном людини. За словами старшого наукового дослідника Hugging Face Льюїса Тансталла, інструмент може допомагати в оцінюванні того, чи є генетична мутація нешкідливою або пов’язаною із захворюванням, а також у розробленні таргетних препаратів і генетичних терапій.
Розробники обрали відносно компактну модель із 14 мільярдами параметрів, щоб її можна було запускати на обладнанні користувача без передавання даних Hugging Face чи іншим компаніям. Водночас команда застерегла, що прогнозів Carbon-X ще не перевіряли експериментами в лабораторії, тому точність моделі наразі не встановлена.
