Науковці описали механізм активації TFEB за лізосомального стресу
Дослідники описали вісь TBK1/ULK1, яка пов’язує лізосомальний стрес з активацією транскрипційного фактора TFEB.
Міжнародна група дослідників описала сигнальну вісь TBK1/ULK1, яка пов’язує лізосомальний стрес із активацією транскрипційного фактора TFEB. Результати роботи опубліковані в Nature.
TFEB регулює мережу генів, пов’язаних з утворенням і функціонуванням лізосом, а також пов’язаний з аутофагією — клітинним процесом перероблення компонентів. Автори дослідження зосередилися на тому, як клітини передають сигнал до TFEB у відповідь на порушення роботи лізосом.
Вісь TBK1 і ULK1
У назві роботи автори визначають TBK1/ULK1 як сигнальну вісь, що поєднує лізосомальний стрес та активацію TFEB. TBK1 є кіназою, яку раніше пов’язували, зокрема, з вибірковою аутофагією, тоді як ULK1 входить до механізмів ініціації аутофагії. Дослідження виконали науковці з інститутів Італії, Швейцарії, Німеччини та США.
Серед авторів — представники Telethon Institute of Genetics and Medicine в Неаполі, Університету Фрібура, Каліфорнійського університету в Берклі та інших наукових установ. Кореспондентним автором статті вказано Дженнаро Наполітано.
Дані про варіанти ATP6V1B2
В одному з додаткових експериментів дослідники використовували клітини HEK293T з індукованою експресією варіантів ATP6V1B2 Y371C і R400Q. Згідно з описом розширених даних, ці патогенні варіанти індукували активацію TFEB, не впливаючи на вісь RagA-mTORC1.
Для роботи автори також застосували фосфопротеомний аналіз і аналіз кіназної активності in vitro. Протеомні дані було розміщено в репозиторії PRIDE у складі ProteomeXchange Consortium під ідентифікаторами PXD069600 та PXD063015. Вихідні дані дослідження додано до статті, а додаткові матеріали доступні за обґрунтованим запитом до кореспондентного автора.
