Науковці склали детальний каталог білків мітохондрій шести організмів
Науковці каталогізували білки мітохондрій шести організмів і виявили тисячі нових родин білків.
Науковці створили детальні каталоги білків мітохондрій у шести організмах — п’яти одноклітинних паразитах і одній рослині. Робота охопила різні гілки еукаріотів та дала змогу виявити білки, яких немає у людини, але які є спільними для паразитів, зокрема збудників малярії та сонної хвороби. Про результати досліджень, оприлюднених 1 жовтня у дев’яти наукових працях, повідомляє Nature.
Нові білки паразитів
Дослідницька група під керівництвом біолога Вансі Мутхи проаналізувала протеоми мітохондрій кількох паразитів, зокрема Giardia lamblia. Цей паразит щороку інфікує близько 280 мільйонів людей у світі та спричиняє діарею. У Giardia виявили 59 мітохондріальних білків: 32 були відомі раніше, ще 27 ідентифікували вперше. Функції 34 із цих білків наразі невідомі.
Після поєднання даних шести організмів із відомими наборами мітохондріальних білків людини та дріжджів науковці сформували колекцію з 8619 білків, віднесених до 3199 родин. Приблизно 43% цих родин раніше не були зафіксовані у великій базі даних білків Pfam. Також дослідники визначили 33 родини білків, що збереглися у еукаріотичних патогенів, але відсутні у людини. Автори роботи вважають, що такі білки можуть бути мішенями для терапій, спрямованих на паразитів.
Пошук походження мітохондрій
Мітохондрії виробляють енергію для еукаріотичних клітин і мають власну невелику ДНК, відмінну від ядерної. Білки цих органел кодуються як мітохондріальною, так і ядерною ДНК. Більшість попередніх знань про мітохондрії ґрунтувалася на дослідженнях людини та дріжджів.
Для аналізу еволюції мітохондрій команда нанесла лінії мітохондріальних протеомів на філогенетичне дерево еукаріотів. За допомогою моделі штучного інтелекту науковці дослідили відомі геноми 203 еукаріотів і передбачили, які закодовані ними білки належать до мітохондрій. Так було виявлено 1420 родин, яких немає у наявних наборах даних. Результати також стосуються дискусії про те, чи виникли мітохондрії на ранньому або пізньому етапі еволюції еукаріотів.
