У дрозофіл виявили зв’язок Lsp2 з mTORC1 і тривалістю життя
Дослідження описало зв’язок білка Lsp2 із mTORC1, трансляцією TOP мРНК і тривалістю життя дрозофіл.
Дослідники описали зв’язок білка Lsp2 із комплексом mTORC1, трансляцією TOP мРНК і тривалістю життя плодових мушок Drosophila. Про це йдеться у статті, опублікованій у Nature.
Робота присвячена ролі Lsp2 у механізмі, що поєднує сигналізацію mTORC1 із трансляцією TOP мРНК. Автори також досліджували цей зв’язок у контексті тривалості життя Drosophila.
Дані дослідження
Для аналізу автори використали дані секвенування РНК, транслятомні та протеомні дані. Набори даних RNA-seq оприлюднено в базі Gene Expression Omnibus під номером GSE295794, а транслятомні дані — під номером GSE297586.
Протеомні дані дослідження розмістили в консорціумі ProteomeXchange через репозиторій iProX з ідентифікатором PXD063648.
Відкритий доступ до аналізу
Автори повідомили, що код для аналізу TOP мРНК, даних секвенування мРНК, моносомного та полісомного секвенування доступний через Zenodo. У роботі також використано бази даних білків Drosophila melanogaster, референтний геном BDGP6.46, FlyAtlas 2 і KEGG, а для прогнозування TOP мРНК у дрозофіл — 49 наборів CAGE-seq для семи видів.
